传染病

健康的人与有助于保护宿主免受病原体(通常被定义为具有致病能力的微生物)入侵的微生物区系和谐相处。微生物区系主要是细菌和真菌，包括正常的常驻区系，它们持续存在，一旦受到干扰，就会迅速重新建立自己，以及短暂区系，它们可能在宿主上定植数小时到数周，但不会永久地建立自己。正常菌群的有机体偶尔会引起疾病，特别是当防御被破坏时。

实验室检测可以直接(例如，视觉上，使用显微镜，培养有机体)或间接(例如，识别有机体的抗体)识别有机体。测试的一般类型包括

可以实现免疫

细菌可以根据它们对氧的需求和耐受性来分类:

人类寄生虫是生活在人身上或体内并从人(宿主)身上获取营养的有机体。寄生虫有三种:

虫媒病毒(节肢动物传播的病毒)适用于通过某些种类的吸血节肢动物(主要是昆虫(苍蝇和蚊子)和蛛形纲动物(蜱虫)传播给人类和/或其他脊椎动物的任何病毒。虫媒病毒不是目前基于病毒基因组的性质和结构的病毒分类系统的一部分。

细菌是具有环状双链DNA和细胞壁(支原体除外)的微生物。大多数细菌生活在细胞外，但有些细菌优先驻留并在细胞内复制。专性细胞内病原体只能在宿主细胞内生长、繁殖和引起疾病。这些病原体包括衣原体，Chlamydophila物种,rickettsiae。兼性细胞内病原体能够在宿主细胞内外生存和繁殖。这些病原体的例子包括伤寒沙门氏菌、布鲁氏菌种、土拉弗朗西斯菌、淋病奈瑟菌、脑膜炎奈瑟菌、军团菌和李斯特菌种以及结核分枝杆菌。

绦虫是扁平的寄生虫。人类肠道囊虫的四种主要病原体是

三种衣原体引起人类疾病，包括性传播感染和呼吸道感染。所有这些都对大环内酯类药物(如阿奇霉素)、四环素类药物(如多西环素)和氟喹诺酮类药物敏感。

COVID-19是一种由新型冠状病毒SARS-CoV-2引起的急性、有时是严重的呼吸道疾病。预防措施包括接种疫苗、感染控制预防措施(如戴口罩、洗手、保持社交距离、隔离受感染者)。诊断是通过抗原或PCR(聚合酶链反应)检测上或下呼吸道分泌物。治疗方法包括支持性护理、抗病毒药物、单克隆抗体或皮质类固醇。

肠病毒，连同鼻病毒(见普通感冒)和人类parechovirus，都是小核糖核酸病毒(皮科或小的RNA病毒)。所有肠道病毒在抗原上都是异质的，并有广泛的地理分布。

自由生活的变形虫是独立生活在土壤或水中的原生动物，不需要人类或动物宿主。与寄生的阿米巴相比，它们很少引起疾病痢疾阿米巴，这是肠道感染(阿米巴病)的常见原因。致病性自由生活的变形虫属Acanthamoeba，Balamuthia，Naegleria,Sappinia．

真菌感染通常分为两种

革兰阴性杆菌是许多疾病的罪魁祸首。有些是在正常肠道菌群中存在的共栖生物。这些共生生物加上来自动物或环境宿主的其他生物可能引起疾病。

不动杆菌属革兰氏阴性菌，可在任何器官系统中引起化脓性感染;这些细菌往往是住院病人的机会主义者。

肠球菌是革兰氏阳性兼性厌氧生物。粪肠球菌而且大肠都有效可引起多种感染，包括心内膜炎、尿路感染、前列腺炎、腹腔内感染、蜂窝织炎和伤口感染以及并发菌血症。

炭疽热是由革兰氏阳性菌引起的炭疽杆菌，它们是产毒、囊化的兼性厌氧生物。炭疽热是一种致命的动物疾病，通过接触受感染的动物或其产品传播给人类。在人类中，感染通常通过皮肤获得。吸入性感染较少见;口咽、脑膜和胃肠道感染很少见。对于吸入性和胃肠道感染，非特异性的局部症状通常在几天后出现严重的全身疾病、休克，经常死亡。经验性治疗是环丙沙星、左氧氟沙星、莫西沙星或多西环素。已经有了疫苗。

八种疱疹病毒感染人类()。在初次感染后，所有疱疹病毒都潜伏在特定的宿主细胞内，随后可能重新激活。原发感染引起的临床症状可能与这些病毒重新激活引起的临床症状有很大不同。疱疹病毒在宿主外无法存活很长时间;因此，病毒的传播通常需要亲密接触。在潜伏感染的人群中，病毒可以在不引起症状的情况下重新激活;在这种情况下，出现无症状的脱落，人们可以传播感染。

人类免疫缺陷病毒(HIV)感染是由两种类似的逆转录病毒(HIV-1和HIV-2)中的一种造成的，它们破坏CD4+淋巴细胞，损害细胞介导免疫，增加某些感染和癌症的风险。初次感染可引起非特异性发热性疾病。后续表现(与免疫缺陷相关)的风险与CD4+淋巴细胞耗竭的水平成正比。HIV可以直接损害大脑、性腺、肾脏和心脏，导致认知障碍、性腺功能减退、肾功能不全和心肌病。表现从无症状的携带到获得性免疫缺陷综合征(艾滋病)，其定义为严重的机会性感染或癌症或CD4计数为200/mcL。HIV感染可以通过抗体、核酸(HIV RNA)或抗原(p24)检测进行诊断。筛查应定期提供给所有成年人和青少年。治疗目的是通过使用≥2种抑制HIV酶的药物组合来抑制HIV复制;如果持续抑制复制，治疗可以恢复大多数患者的免疫功能。

原生动物是某些有核的单细胞生物(真核生物)的泛称，它们没有细胞壁，既不是动物，也不是植物，也不是真菌。引起人类肠道感染的最重要的肠道原生动物病原体包括

结核病是一种慢性进行性分枝杆菌感染，在初次感染后通常有无症状的潜伏期。肺结核最常感染肺部。症状包括咳嗽、发烧、体重减轻和不适。诊断通常是通过痰涂片和培养，如果有条件，则通过核酸扩增试验。治疗方法是服用多种抗菌药物至少4个月。

血管圆线虫病是由线虫属的幼虫感染的摘要．视乎感染种类而定，腹部症状(摘要costaricensis)或嗜酸性粒细胞性脑膜炎的神经受累(答:cantonensis)的结果。根据病史和脑脊液(CSF)和/或血液中存在嗜酸性粒细胞增多症怀疑诊断。驱虫药不是无效就是有害。

猴痘是由猴痘病毒引起的orthopoxvirus结构上与天花病毒有关患者表现为水泡状或脓疱状皮疹，可能疼痛，常伴有发热、不适和淋巴结肿大。诊断是通过聚合酶链反应(PCR)。治疗通常是支持性的，可能会使用抗病毒药物。预防包括接种疫苗。

病毒感染通常影响上呼吸道或下呼吸道。虽然呼吸道感染可以根据致病病毒(如流感)进行分类，但在临床上通常根据综合症(如普通感冒、毛细支气管炎、肺炎)进行分类。虽然特定的病原体通常会引起特征性的临床表现(例如，鼻病毒通常会引起普通感冒，呼吸道合胞病毒[RSV]通常会引起细支气管炎)，但每种病原体都可以引起多种病毒性呼吸综合征。

立克次体疾病(立克次体病)和相关疾病(无形体病、埃立克体病、Q热、恙虫病)是由一组革兰氏阴性、细胞内专门的球菌引起的。所有,除了伯纳特氏立克次氏体，有节肢动物载体。症状通常包括突然发作的发烧，伴有严重头痛、不适、虚弱，在大多数情况下，还会出现特征性皮疹。通过免疫荧光试验或聚合酶链反应(PCR)进行临床诊断。一线治疗是使用强力霉素，一种四环素。

性传播感染，又称性传播疾病，可由许多微生物引起，这些微生物在大小、生命周期、所引起的疾病和症状以及对现有治疗方法的敏感性方面都有很大差异。

Bejel、pinta和雅司病(地方性密螺旋体病)是通过身体接触传播的慢性热带非性病螺旋体感染。bejel的症状是粘膜和皮肤病变，其次是骨和皮肤胶结。雅司病会引起骨膜炎和皮肤损伤。品状病变局限于真皮层。诊断包括临床和流行病学。治疗是用青霉素。

吸虫是寄生扁形虫，会感染血管、胃肠道、肺或肝脏。它们通常根据它们所侵犯的主要器官系统进行分类:

病毒是最小的寄生虫，通常在0.02到0.3微米之间，尽管最近发现了几种长可达1微米的非常大的病毒(巨病毒、潘多拉病毒)。病毒完全依靠细胞(细菌、植物或动物)繁殖。病毒的外层是蛋白质，有时是脂质，RNA或DNA核心，有时是病毒复制的第一步所需的酶。